El comparativo del Manual de Percepciones de las y los Servidores Públicos de la Comisión Nacional de los Derechos Humanos (CNDH), muestra que Rosario Piedra Ibarra, su presidenta actual, percibirá este año un sueldo equivalente de 159 mil 227.83 pesos al mes y un aguinaldo de 321 mil 547 pesos, cuando el presidente Andrés Manuel López Obrador solo recibe un sueldo de 108 mil pesos al mes. 

De acuerdo con una investigación de Excélsior, lo anterior destaca por la política de austeridad que el Gobierno de López Obrador, en la cual nadie puede percibir un sueldo mayor al de él; incluso, Piedra Ibarra gana hasta 5 mil pesos más que su antecesor durante el año pasado, Luis Raúl González Pérez, quien recibió 154 mil 66.60 pesos. 

El sueldo base de González Pérez fue por 29 mil 52 pesos con una compensación garantizada de  125 mil 14 pesos; en tanto que Piedra Ibarra tiene un sueldo base de 30 mil pesos y una compensación garantizada de 129 mil 202 pesos.

Además de ella como presidenta de la Comisión, en 2019 los visitadores recibían 152 mil 324.80 pesos y el oficial mayor 151 mil 245.41 pesos, pero este año han tenido un aumento; los primeros tendrán 157 mil 427.68 pesos (5 mil 102.88 pesos más), mientras que el segundo percibirá 156 mil 312.13 pesos (5 mil 66.72 pesos más).

Debido a la austeridad implementada por el Gobierno Federal, empleados de la Comisión han sufrido recortes de bonos y prestaciones, como los vales de despensa y el seguro semestral.